深圳大学医学部现有学生3195人，其中本科生1989人，研究生1206人（含留学生39人）。现有本科专业六个：临床医学（含卓越班）、生物医学工程（含卓越班和创新班）、药学、护理学（含特色班）、口腔医学和预防医学，其中省级医学实验教学示范中心一个。一级学科博士点二个：生物医学工程、生物学，二级学科博士点一个：生物医学信息处理，一级学科硕士学位授权点两个：生物医学工程、基础医学，专业学位硕士授权点三个：生物医学工程领域工程硕士、临床医学专业硕士和药学专业硕士，国际化专业两个：分子医学硕士和生物医学工程（医学、工学、理学方向）博士。与德国耶拿大学联合培养生物医学博士项目：10名/年，通过耶拿大学博士论文答辩可以获颁耶拿大学博士学位。临床医学、生物学与生物化学分别进入ESI学科世界排名前0.5%和1%。生物医学工程学科参加全国第四轮学科评估，排名并列第15名（B类）。2019年初，深圳大学第一附属医院（深圳市第二人民医院）以深圳市唯一一家医院、广东省两家医院之一的名义进入ESI临床医学学科全球机构1%名单，标志着第一附属医院在临床医学学术水平及影响力等方面进入了国际领先水平。软科2019“中国最好学科排名”榜中，医学部基础医学学科排在全国同类学科的前29%，从2018年的第38名跃升7个名次到第31名；生物医学工程学科排在在全国同类学科的前25%，从2018年的第29名跃升8个名次到第21名。2021年度泰晤士高等教育公布的中国学科评级结果中，深圳大学医学部生物医学工程学科被评为A级学科，基础医学学科评为B级学科。
学部现有教职工620人，其中全职教研人员279人（特聘教授27人、教授35人、副教授46人、高级讲师1人、助理教授/讲师103人，研究员3人、副研究员64人），有在站博士后180人。教研人员中大部分具有海外留学或工作经历，博士学历者占95%。
医学部重视科研平台建设，提升学部整体竞争力。
2008年-2021年累计承担科研项目1605项，总经费约13.4488亿，其中科技部项目37项。
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